R Markdown: vědecké reporty, které se aktualizují samy
Vědecké reporty, které se aktualizují samy: R Markdown spojí text, kód i grafy do PDF, Wordu či HTML. Konec ručního kopírování výsledků.
Vede Mgr. Tomáš ChupáňLektor biostatistiky · Datová akademieO kurzu
Kopírujete výsledky a grafy ručně do Wordu – a při každé změně dat znovu? S R Markdown to skončí. Naučte se psát vědecké články a atraktivní výstupy, které se z vašich dat vygenerují samy.
Po absolvování kurzu zvládnete v R Markdown vytvořit dokumenty ve formátech vyžadovaných různými periodiky, vložit do nich výzkumná data a ta vhodným způsobem vizualizovat.
Procvičování příkladů probíhá v anglické verzi aplikace RStudio. Počítač vám zapůjčíme na místě, není třeba nosit vlastní.
Kurzem vás provede Mgr. Tomáš Chupáň – Lektor biostatistiky, Datová akademie.
Pro koho je kurz?
Výzkumníci a vědci
Chcete automatizovat výzkumné reporty a eliminovat chyby copy-paste.
Doktorandi
Potřebujete reprodukovatelnou metodologii pro disertaci nebo publikaci.
Datoví analytici
Tvoříte opakující se reporty a chcete je automatizovat.
Akademici s výukovými povinnostmi
Chcete připravovat materiály a handouty přímo z R.
Předpoklady
Pro účast na kurzu je vhodné mít znalosti v rozsahu kurzů Jazyk R za 1 den: základy pro analýzu vašich dat a Statistika I v R: správný test a výsledky, které obhájíte.
Osnova kurzu
Úvod do R Markdownu
- Představení Markdown
- K čemu se Markdown používá
- Možnosti a výhody použití R Markdownu pro výzkumníky
Základy syntaxe Markdownu
- Formátování textu
- Vkládání odkazů, obrázků a tabulek
- Tvorba seznamů, poznámek pod čarou a citací
Integrace R kódu v Markdownu
- Základní syntaxe R kódu
- Výpočty a manipulace s daty v R
- Vkládání výsledků výpočtů do dokumentu
Tvorba grafů a vizualizace v R Markdownu
- Vytváření statických a interaktivních grafů
- Představení různých způsobů pro vizualizaci dat
- Vkládání grafů do dokumentu
Prezentace a další formy využití
- Vytváření prezentací v R Markdownu
- Export dokumentů do různých formátů (PDF, HTML, Word)
- O krok napřed: rozšiřující pojmy a nástroje (quarto, knihy, webové stránky)
Váš lektor
Mgr. Tomáš Chupáň
Lektor biostatistiky
Datová akademie
Tomáš Chupáň je statistik a datový analytik, který se specializuje na analýzu biomedicínských dat. V současné době působí ve Fakultní nemocnici Olomouc jako výzkumný pracovník Centra digitálního zdravotnictví, kde spolupracuje s lékaři napříč různými klinikami.
Celý profil, vzdělání a publikaceCo dostanete
Co říkají absolventi
„Přestal jsem ručně kopírovat čísla z R do Wordu. Teď generuji celou metodologickou sekci automaticky. Ušetřím hodiny týdně.“
„R Markdown mi změnil přístup k vědecké práci. Kdokoliv může zreprodukovat mé výsledky jedním kliknutím.“
Otázky k tomuto kurzu
Máte jinou otázku? Zavolejte nám nebo napište.
R Markdown je formát pro tvorbu dokumentů, které kombinují R kód, výsledky analýz a text. Výsledkem je reprodukovatelný report – PDF, Word nebo HTML – který lze kdykoli znovu vygenerovat z aktuálních dat.
Je vhodné mít znalosti v rozsahu kurzů Jazyk R za 1 den: základy pro analýzu vašich dat a Statistika I v R: správný test a výsledky, které obhájíte, tedy orientovat se v RStudiu a základní práci s daty a grafy.
Ne. Pro generování PDF se o sazbu postará nástroj na pozadí (např. tinytex) – LaTeX ovládat nemusíte.
Quarto je novější nástupce R Markdownu s podporou více jazyků (R, Python, Julia). V kurzu na něj v závěru navážeme jako na krok napřed.
Ano. Řada zahraničních i českých akademiků píše celé práce v R Markdownu. Ukážeme si i export do formátů vyžadovaných různými periodiky.
Prezenčně v našem školícím středisku 4D Center, Kodaňská 1441/46, Praha 10. Je jednodenní a vedený prakticky na příkladech v anglické verzi aplikace RStudio.
Nemusíte. Počítač s připraveným prostředím vám zapůjčíme na místě. Práce na vlastním notebooku je možná – stačí nám dát předem vědět.
Maximálně 10. Malá skupina umožňuje individuální přístup a prostor pro vaše konkrétní dotazy.
Po absolvování vám vystavíme osvědčení. Aktuální cenu kurzu vidíte na této stránce. ; platba probíhá převodem oproti faktuře, kterou vystavíme na IČO a doplníme podklady pro grant či dotaci.
Přihlášku můžete bezplatně zrušit nejpozději 14 dní před začátkem kurzu; přihláška je navíc nezávazná a po jejím odeslání se vám do 3 pracovních dnů ozveme.
Máte jinou otázku? Napište nám nebo zavolejte 602 284 038.
Příbuzné kurzy
8 900 Kč bez DPH
10 769 Kč s DPH
„Přestal jsem ručně kopírovat čísla z R do Wordu. Teď generuji celou metodologickou sekci automaticky…“
Mgr. Ondřej Blažek
Přihláška je nezávazná · odpovíme do 24 hodin · storno zdarma 14 dní předem
Lze hradit z grantů a firemního vzdělávání
Fakturujeme na IČ firmy nebo instituce. Pro granty (GA ČR, TA ČR, OP JAK) i programy firemního vzdělávání vystavíme všechny potřebné dokumenty.
Takhle to u nás vypadá
- 4D Center, Praha
- Počítač na místě
- Max. 10 účastníků
Cena kurzu
8 900 Kč bez DPH